当进行生物学评价时，应按照GB/T16886.1-2011中给出的程序开展生物学评价。这一程序是标准编制者在生物学评价基本原则指导下设计的。因此，按该标准给出程序开展生物学评价能有效保护动物、降低评价成本和提高评价效率。
不宜对公认的阴性对照材料开展动物学试验 现实中有不少医疗器械是采用公认的阴性对照材料制造的，如用作植入材料的超高分子量聚乙烯。
所谓的阴性对照材料，是指用于医疗器械动物试验中阴性动物对照组使用的材料，试验结果中如果阴性对照组出现了阳性结果，说明试验操作不符合要求。在GB/T16886.12《医疗器械生物学评价 第十二部分：样品制备与参照样品》中结出了阴性对照的清单，这些材料有充分的科学数据证明其具有生物安全性。
在对这类有充分安全使用史的材料制定产品标准时，合理的做法是在标准中规定鉴别和纯度等理化方面的要求，不宜规定生物学方面的试验要求，以避免开展不必要动物试验，除非已知材料在加工过程中引入了不能被有效去除的有害物质。